- Skype практически невозможно прослушать, за что его критикуют спецслужбы многих стран.[47] В то же время сам сервис не раз обвинялся в шпионаже в пользу США и Китая.[48]
- Одним из недостатков Skype считается использование проприетарного протокола, несовместимого с открытыми стандартами (такими, как SIP или H.323). Однакооператор российской сети Sipnet сумел наладить взаимодействие со Skype.[49]
- В процессе работы Skype генерирует типичный для P2P-сетей и неизбежный постоянный трафик, который может достигать гигабайта в месяц.[50] Решением данной проблемы может быть запрет в файрволе входящих соединений для Skype.[51]
- На конференции Black Hat Europe 2006, посвящённой вопросам информационной безопасности, был представлен анализ Skype.[52] Среди прочего, там были отмечены:
-
- интенсивное использование антиотладочных приёмов и обфусцированного кода;
- постоянная передача данных (даже в ситуациях, когда сама программа находится в режиме ожидания);
- использование 3G-сетей.
- Крис Касперски активно критикует Skype[53]:
Skype — это чёрный ящик с многоуровневой системой шифрования, напичканного антиотладочными приемами исполняемого файла, считывающий с компьютера конфиденциальную информацию и передающий ее в сеть по закрытому протоколу. Последний обходит брандмауэры и сурово маскирует свой трафик, препятствуя его блокированию. Все это превращает Skype в идеального переносчика вирусов, червей и дронов, создающих свои собственные распределенные сети внутри Skype-сети. …
Skype активно изучается в хакерских лабораториях и security-организациях по всему миру, и большинство исследователей единодушно сходятся во мнении, что Skype — это дьявольски хитрая программа, написанная бесспорно талантливыми людьми в стиле Black Magic Art. Skype не брезгует грязными трюками, создающими огромные проблемы
- К версии Skype под Linux высказываются претензии о том, что им читаются файлы, содержащие пароли.[54][55]
- В феврале 2007 стало известно об ошибке, в результате которой Skype создаёт в каталоге для временных файлов файл 1.com, который позволяет считывать информацию из BIOS. Согласно информации из официального блога, это было вызвано использовавшейся в подключаемом модуле Skype Extras Managerсистемы безопасности, изготовленной фирмой EasyBits Software, которая таким образом получала серийный номер материнской платы для однозначной идентификации компьютера.[56] Данная система не используется в версиях 3.0.0.216 и старше.